Akusherlik va ginekologiya ilmiy-tadqiqot instituti  1974 yil 23 avgust KP Markaziy qo'mitasi va SSSR Vazirlar Kengashi 418 sonli qarori bilan 2 - tug'ruqxona bazasida Toshkent shaxrida 1 oktyabr, 1974 yilda tashkil etilgan.

Institutning tashkil etishi, zamonaviy tabiiy fan va tibbiyot bilim, davlat sog'liqni saqlash tashkiloti, ta'lim va madaniyat keng markazlari shakllanishi davriga to'g'ri keldi. Institut homilador ayollar va ularning farzandlariga yuqori malakali tibbiy yordam ko'rsatish va malakali kadrlar tayyorlash uchun mo'ljallangan bir vaqtning uzida ham tugruq kompleksi va maxsus ta'lim va ilmiy muassa hisoblangan O'zbekistondagi eng birinchi ilmiy tadqiqot instituti bo'ldi. 

Institutda ilmiy tadqiqot quyidagi asosiy yo'nalishlarda rivojlantirish bilan ishonib topshirilgan edi:

- Homilador ayollar salomatligiga iqlim-geografik va sanoat sharoitida zararli ta'siridan funktsional tadqiqotlar olib borish; neonatal va onalar o'z-o'zidan abort, xomilalik, o'lim, olib keluvchi sabablar va ularda hematopoetik funktsiyasi, akusherlik qon ketish turli kasalliklarning rivojlanish mexanizmlarini o'rganish.

- Patogen agentlar va homilador ayollar va ularning davolash kasallik asosiy turlarini oldini olish uchun usullarini yaratish.

Institut faoliyati mobaynida  ayollar salomatligini yaxshilashga qaratilgan bir qancha hukumat dasturlarini muvaffaqiyatli ijro etilib kelindi.

19 sentyabr 2007 O'zbekiston Respublikasi Prezidentining Farmoniga binoan "Respublika ixtisoslashtirilgan ilmiy-amaliy tibbiyot markazlari faoliyatini tashkil etish to'g'risida" PF-3929 "Sog'liqni saqlash tizimini yanada rivojlantirishning asosiy yo'nalishlari to'g'risida" va O'zbekiston Respublikasi Vazirlar Mahkamasi va 21 may 2009 yil №145 sonli  qaroriga muvofiq Akusherlik va gynekologiya ilmiy tadqiqot instituti Respublika ixtisoslashtirilgan akusherlik va ginekologiya ilmiy-amaliy tibbiyot markazi deb qayta nomlandi.

Bugungi kunda Markaz O'zbekistonda istiqomat qiluvchi barcha ayollarga yuqori texnologiyali tashhislash va davolash usullaridan foydalangan holda makalaki tibbiy yordam ko'rsatib kelayotgan etuk tibbiyot muassasasi hisoblanadi. Mamlakatning to'rt viloyatlarida - Qashqadaryo viloyati, Namangan viloyati, Jizzax viloyati va Qoraqalpog'iston Avtonom Respublikasi - Markazning filiallari o'rnatilgan bp'ib, mazkur filiallar ayni paytda hududlarda aholiga yuqori sifatli tibbiy yordam berish bo'yicha o'z majburiyatlarini muvaffaqiyatli bajarib kelmoqdalar.

Turli yillarda ilmiy-tadqiqot instituti direktorlari:

• 1974-1988 yil Xodjaeva Rano Hodjaevna NIIAiG birinchi direktori
• 1988-1989 yillarda Mahmudov Maqsud Arifjanovich
• 1989-1997 yillarda Asadov Damin Abduraxmonovich
• 1997-1998 yillarda Sultanov Saidazim Nasirovich
• 1998-2008 yillarda Kurbanov Jahangir Djamalovich
• 2008-2014 yillarda Sultanov Saidazim Nasirovich
• 2015-2017 yillarda Najmutdinova Dilbar Kamariddinovna
• Hozirgi vaqtda Maksudova Dilnozxon Saidkamalovna