На базе ГО РСНПМЦ А и Г МЗ РУз действует крупный лабораторный отдел, в состав которого входят 6 подразделений:
1. Лаборатория гемостаза
2. Лаборатория клинической иммунологии с диагностикой СПИД
3. Клинико-биохимическая лаборатория
4. Бактериологическая лаборатория
5. Отдел патоморфологии
6. Кабинет сперматолога
В составе лабораторного отдела Центра трудятся 56 сотрудников, из них 23 врача-лаборанта, 21 лаборант и 12 санитарок. Среди врачей-лаборантов 1 кандидат биологических наук, 14 имеют высшую квалификационную категорию. Сотрудники лабораторного отдела имеют большой стаж работы, принимают участие в научных конференциях, семинарах, а также научных исследованиях Центра.